| 重新乾燥： |
不管是乾式或濕式加工，所得之初級生咖啡豆的乾燥度通常都不足，需要重新加以乾燥，使水分確實降到11~12﹪，使易於脫殼或去膜。 |
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| 清 潔： |
乾燥的含膜生咖啡豆及部分乾燥之咖啡果實仍含有許多雜質，如石頭、金屬片及其它外來物質。這些雜質都應加以去除，以免損傷後續的加工設備。生咖啡豆可以經由漏斗通過篩網，去除大型雜物及中型不純物，再用磁鐵吸取金屬片，最後再用風選機分離其他雜質。 |
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| 脫殼及脫膜： |
在濕式法加工生豆中，外殼及圍繞生豆之乾燥外膜都需要立即去除之，乾式加工之生豆要進行脫殼，若要完全去除銀白色外膜，則需要以精磨機拋光處理。 |
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| 大小分級： |
不同大小之生咖啡豆有不同的等級及售價，因此需要進行分級。一般而言，顆粒較大的生豆較值錢，顆粒大小較整齊者也較好，將形狀不同的生豆，如扁平豆及半圓豆加以分離，有助於使後續密度選別更為容易，更有助於未來烘焙之均勻性，也有助於咖啡質量之提升。 |
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| 密度選別： |
主要利用風選或重力分離的方式，將比重較輕之變形、變色或有病蟲害之生豆加以分離。 |
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| 顏色選別： |
變色的生豆通常利用電眼來加以選別。 |
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| 保 存： |
在生產國當地之生咖啡豆的保存，不是以乾燥果實就是以乾燥含膜生豆的方式來保存。帶殼之咖啡果實因帶有外殼，可提供良好的保護，可避免昆蟲及水分入侵。生咖啡豆在進行保存時之水分含量不應超過12﹪在此水分含量之下，可將黴菌的生長及酵素的活性降至最低。當空氣的相對濕度超過74﹪時，無害的黴菌 會開始生長，在濕度達到85﹪以上時， 酵母菌及細菌可開始繁殖，因此保存時間之長短，端視保存濕度及溫度而定。保存過程中會生成一些生物化學反應，結果生成變色作用，其詳細之化學變化專家們至今尚未完全明瞭。 |
